sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-EJ-A46G	1	61735	2167149	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	2173638	4945228	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	4945481	30381916	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	30382007	32534105	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	32535799	42125679	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	42131623	42531653	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	42535994	46071436	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	46072840	46625918	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	46626926	57973322	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	57979666	60613082	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	60613343	77755612	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	77755686	81258873	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	81258943	82398355	4	1
TCGA-EJ-A46G	1	82398773	84549957	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	84550774	85016559	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	85017172	88078503	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	88082213	100099532	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	100100657	100356278	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	100357452	101111282	5	1
TCGA-EJ-A46G	1	101111633	104155731	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	104155802	110974248	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	110974378	112263682	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	112263862	121482979	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	144007049	145792064	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	145932468	150238095	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	150250176	151448405	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	151456015	152390621	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	152391282	153225921	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	153226033	155667221	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	155674370	159637123	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	159638931	160221703	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	160221724	178569870	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	178570488	179419266	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	179422618	180152260	2	2
TCGA-EJ-A46G	1	180156667	185520663	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	185522687	204403311	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	204403659	205660239	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	205661367	207288392	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	207295298	213586674	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	213587857	216153695	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	216154070	232285238	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	232289764	232715435	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	232717442	236622351	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	236625290	236928683	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	236928823	249224388	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	12784	6615530	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	6616139	7131261	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	7132915	10241344	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	10241915	11797949	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	11800098	18648687	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	18648838	19003518	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	19005544	23902722	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	23904515	24391733	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	24391894	34169351	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	34169616	36021254	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	36021482	42656456	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	42656919	44190439	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	44190965	64283714	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	64285875	64878987	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	64879619	77012245	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	77014985	77452866	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	77453344	131865064	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	131866050	134806727	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	134809430	151278840	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	151279247	152529255	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	152530036	154405080	4	1
TCGA-EJ-A46G	2	154405397	172686290	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	172686304	174308645	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	174313400	175600891	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	175601966	177657237	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	177657307	217573269	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	217573692	219484904	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	219492724	226840888	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	226842730	227976331	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	227977635	229266374	3	1
TCGA-EJ-A46G	2	229268856	233341746	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	233342618	243089456	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	60345	2384160	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	2384279	4420465	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	4422399	6936157	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	6936832	9421024	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	9421187	29518773	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	29519698	30314507	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	30314670	31264798	4	1
TCGA-EJ-A46G	3	31270359	32420366	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	32426211	59733262	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	59734494	60047100	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	60047114	70306194	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	70306417	72971292	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	72971441	75351781	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	75351986	75843507	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	75849632	104545791	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	104548837	105009102	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	105014940	105590624	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	105597419	108319575	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	108320437	110103831	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	110104266	112149147	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	112150538	114414260	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	114419948	116899786	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	116899849	146653363	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	146653614	150867063	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	150868755	163187858	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	163191120	164412701	4	1
TCGA-EJ-A46G	3	164427282	166217539	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	166220743	169633759	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	169634916	169866633	3	1
TCGA-EJ-A46G	3	169868550	171008002	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	171015828	171922055	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	171922127	172462434	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	172464000	185906359	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	185907438	186208650	3	1
TCGA-EJ-A46G	3	186209525	187445961	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	187446048	187514731	1	0
TCGA-EJ-A46G	3	187515331	193228079	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	193231560	193374964	5	1
TCGA-EJ-A46G	3	193376227	193593889	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	193596062	196676759	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	196677409	197896118	1	0
TCGA-EJ-A46G	4	12281	20599948	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	20601341	22692864	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	22693166	30663240	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	30663891	32642292	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	32643159	37409102	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	37409137	37865961	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	37866665	48301237	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	48301691	49051202	3	1
TCGA-EJ-A46G	4	49051486	72356802	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	72357098	72735284	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	72738432	80232915	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	80234833	80887185	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	80896309	85066641	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	85068653	85707284	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	85708116	95146281	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	95147055	101947299	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	101947848	118650095	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	118650345	118789715	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	118789858	120390194	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	120390240	121277621	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	121278007	126734369	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	126737811	129331842	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	129332083	138109276	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	138109789	141075895	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	141078304	153783127	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	153785684	154467681	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	154470491	171710982	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	171714622	175251921	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	175253812	180633395	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	180633683	181562135	3	1
TCGA-EJ-A46G	4	181562629	183152803	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	183156576	191027923	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	15532	42928720	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	42929110	43910748	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	43916607	85258046	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	85258292	85942744	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	85943936	120682373	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	120683341	122059025	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	122063180	124387905	2	2
TCGA-EJ-A46G	5	124389371	125210769	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	125212183	138532675	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	138538479	142424934	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	142426736	153585114	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	153585868	154427136	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	154431377	155987523	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	155987898	156645737	3	1
TCGA-EJ-A46G	5	156646312	157381358	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	157385133	160034484	2	2
TCGA-EJ-A46G	5	160034707	160953901	3	2
TCGA-EJ-A46G	5	160955349	161321257	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	161321468	165935196	3	1
TCGA-EJ-A46G	5	165935694	167587700	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	167588722	173307943	3	1
TCGA-EJ-A46G	5	173310607	179614132	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	179614846	179959420	4	1
TCGA-EJ-A46G	5	179971139	180790320	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	149661	1386697	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	1397495	1586455	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	1590072	7176497	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	7178539	7867046	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	7867412	28253724	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	28254988	28665109	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	28665362	37502869	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	37508106	38440496	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	38440769	40183668	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	40183697	42387046	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	42387499	56549312	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	56552636	62273181	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	62273698	64191778	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	64193107	66168409	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	66171125	67795824	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	67795945	70359738	3	1
TCGA-EJ-A46G	6	70359756	95894308	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	95894399	97061884	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	97061940	97328181	4	1
TCGA-EJ-A46G	6	97329627	97952521	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	97953745	104009076	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	104009420	105533386	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	105536491	106916691	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	106919198	107396658	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	107397053	115214471	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	115214535	117545367	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	117546605	121934520	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	121934685	126149068	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	126152137	129226616	3	1
TCGA-EJ-A46G	6	129236667	131320656	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	131321008	149959602	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	149959827	155749494	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	155750219	156049794	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	156054130	159658886	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	159662064	165588626	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	165588629	167152526	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	167152967	167814765	3	1
TCGA-EJ-A46G	6	167815002	171051005	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	43259	4056433	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	4059858	4375700	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	4376272	11850310	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	11852822	13463114	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	13466992	18666217	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	18666901	24694758	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	24696108	29952481	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	29953543	31671631	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	31672136	53067490	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	53067860	53587986	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	53590747	72761076	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	72761420	74286822	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	74302277	86434619	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	86438264	86908288	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	86914164	96181391	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	96187741	101007720	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	101007777	106065174	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	106068062	108684329	4	1
TCGA-EJ-A46G	7	108686876	120003056	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	120006069	121641666	3	1
TCGA-EJ-A46G	7	121642360	122084835	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	122085201	127625636	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	127625717	129900644	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	129900895	136116323	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	136120119	136639941	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	136641923	153146642	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	153146779	153578146	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	153578416	159127004	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	31254	8093182	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	8094763	8451524	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	8453388	17755668	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	17755813	20576344	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	20578582	53325195	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	53327381	53809573	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	53809758	65216592	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	65216854	68561439	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	68561738	70232618	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	70239113	72636402	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	72636606	76169661	3	1
TCGA-EJ-A46G	8	76169769	90069433	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	90069524	92313640	5	1
TCGA-EJ-A46G	8	92316589	98991281	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	98991408	99381619	4	1
TCGA-EJ-A46G	8	99382777	120517178	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	120517731	121206440	3	1
TCGA-EJ-A46G	8	121211312	126079969	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	126080268	127883100	5	2
TCGA-EJ-A46G	8	127883114	128655964	4	1
TCGA-EJ-A46G	8	128656651	134318840	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	134320785	134581280	4	1
TCGA-EJ-A46G	8	134585972	146298155	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	46587	27988081	1	1
TCGA-EJ-A46G	9	27992820	31109267	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	31111743	81192819	1	1
TCGA-EJ-A46G	9	81196701	85280998	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	85281408	88054587	1	1
TCGA-EJ-A46G	9	88054636	95226551	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	95226702	95310686	5	0
TCGA-EJ-A46G	9	95322638	95323135	4	3
TCGA-EJ-A46G	9	95323297	96256487	2	2
TCGA-EJ-A46G	9	96256583	97908977	3	3
TCGA-EJ-A46G	9	97909030	98633944	3	1
TCGA-EJ-A46G	9	98637430	108348889	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	108349037	110702554	3	1
TCGA-EJ-A46G	9	110702743	113309537	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	113311958	113631618	4	1
TCGA-EJ-A46G	9	113631766	139825048	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	139825918	140707889	6	1
TCGA-EJ-A46G	9	140708768	141091394	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	72759	24837907	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	24838271	27859351	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	27859418	38178446	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	38183090	38429590	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	38430296	68818332	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	68819759	72798663	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	72801081	88043680	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	88049778	88561324	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	88571778	101526561	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	101529656	108474615	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	108474865	114391220	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	114391388	115357825	3	1
TCGA-EJ-A46G	10	115363766	116004909	4	1
TCGA-EJ-A46G	10	116004968	116595095	3	1
TCGA-EJ-A46G	10	116596100	125666446	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	125673274	127671203	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	127671865	135506704	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	198572	2616835	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	2617782	25553199	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	25554783	26763702	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	26766550	27579171	3	1
TCGA-EJ-A46G	11	27581245	29208679	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	29208885	32649790	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	32651244	35158401	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	35159062	65106393	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	65106588	65106669	3	0
TCGA-EJ-A46G	11	65107169	65140209	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	65140850	66547365	3	1
TCGA-EJ-A46G	11	66548936	66988948	6	2
TCGA-EJ-A46G	11	66990481	68791394	3	2
TCGA-EJ-A46G	11	68792967	70231516	3	1
TCGA-EJ-A46G	11	70235868	73136014	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	73148583	76244493	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	76246953	77172869	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	77175173	78298564	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	78299789	81999479	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	81999984	83414381	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	83414990	86805885	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	86807940	87127635	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	87130316	92543411	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	92548911	95023446	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	95025897	101027344	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	101027702	102143403	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	102143645	123046705	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	123046903	124445855	4	1
TCGA-EJ-A46G	11	124449668	124855981	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	124857828	131263354	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	131267738	131735226	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	131735286	134944770	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	150442	5072446	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	5073375	5598980	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	5599646	17985001	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	17986152	19313454	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	19313789	31113611	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	31115126	32081411	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	32081569	51243411	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	51243580	52264266	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	52264525	52732945	3	1
TCGA-EJ-A46G	12	52733168	54328920	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	54331903	55403194	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	55405829	58010163	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	58018979	59359472	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	59361320	63567200	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	63567321	91522586	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	91530866	94733545	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	94734020	105530527	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	105532164	105874914	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	105876334	118306451	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	118308082	121502087	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	121502168	133778189	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	19026949	20887023	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	20887860	21470525	3	1
TCGA-EJ-A46G	13	21476246	72828535	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	72828877	73159433	2	1
TCGA-EJ-A46G	13	73161435	108514253	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	108514495	111446344	2	1
TCGA-EJ-A46G	13	111446579	114590141	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	114591051	115108397	1	0
TCGA-EJ-A46G	14	19002124	22327315	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	22328002	23006227	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	23010444	34625815	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	34628278	35311272	4	1
TCGA-EJ-A46G	14	35312914	36889689	4	3
TCGA-EJ-A46G	14	36890407	38666890	3	2
TCGA-EJ-A46G	14	38670023	47666718	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	47671059	50577077	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	50578668	60244447	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	60244706	60538029	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	60542407	60754128	3	2
TCGA-EJ-A46G	14	60754455	62938588	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	62941166	73709184	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	73710313	74479767	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	74483553	98873004	1	0
TCGA-EJ-A46G	14	98873038	101014155	2	0
TCGA-EJ-A46G	14	101024434	107285437	1	0
TCGA-EJ-A46G	15	20016328	44224668	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	44225956	46966864	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	46967277	50296308	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	50297886	50861559	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	50868779	56966867	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	56967024	59830770	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	59834840	62577051	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	62579052	62905157	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	62908795	67718217	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	67718782	68032565	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	68032773	75458874	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	75459222	78545996	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	78546189	89435129	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	89435338	90371548	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	90376800	102469040	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	60777	902351	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	910689	3211320	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	3214686	4696654	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	4704433	5794173	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	5794214	27524962	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	27527812	35283226	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	46463782	53475508	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	53475523	53916508	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	53916879	90287535	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	526	1206042	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	1209747	5349193	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	5349972	19130231	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	19149286	21050158	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	21054153	49780250	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	49781360	51884998	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	51885944	57075647	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	57076145	57986930	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	57990669	61591555	3	2
TCGA-EJ-A46G	17	61591652	70304489	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	70305287	70493352	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	70499066	72547434	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	72548037	81049726	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	48133	2377305	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	2378355	2926797	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	2930138	12976560	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	12976655	14236858	4	1
TCGA-EJ-A46G	18	14239701	29210613	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	29212727	29628620	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	29629956	55651773	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	55655351	56541943	6	3
TCGA-EJ-A46G	18	56543957	58790654	4	2
TCGA-EJ-A46G	18	58791231	59008734	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	59009070	74860741	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	74861746	76103285	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	76106514	78015057	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	90910	12378425	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	12384518	15183631	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	15183846	17570202	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	17571138	18495709	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	18499802	32973619	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	32974232	34144791	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	34151697	35333949	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	35334968	36524861	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	36535720	39334811	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	39335274	51261051	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	51264893	52249900	2	2
TCGA-EJ-A46G	19	52250280	52631622	4	1
TCGA-EJ-A46G	19	52635331	54682511	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	54682867	56015797	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	56016602	57027606	3	2
TCGA-EJ-A46G	19	57028079	57712505	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	57713295	59097854	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	61305	3967976	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	3970173	6259532	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	6259725	6628901	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	6633443	7085728	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	7087736	18164883	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	18165774	18588185	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	18589737	30872525	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	30877298	34059337	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	34059675	42051885	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	42055235	45184985	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	45185498	62956153	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	10736871	29315928	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	29315987	29926747	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	29932910	36011689	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	36012002	36267418	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	36268090	37646681	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	37651263	40594384	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	40597413	41853681	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	41853760	45505282	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	45507790	48096957	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	16052528	21929661	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	21934230	22798141	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	22800255	24695964	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	24699264	28043959	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	28044057	33748362	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	33749276	34713375	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	34717923	44818636	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	44821094	45051355	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	45051962	45498909	2	2
TCGA-EJ-A46G	22	45502533	45996782	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	45997140	51234455	1	1
TCGA-EJ-A46G	X	168477	2694240	1	1
TCGA-EJ-A46G	X	2703391	23604900	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	23605025	26520450	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	26524055	35869632	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	35870020	36562728	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	36564503	37551440	3	0
TCGA-EJ-A46G	X	37553483	38786847	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	38789217	95420269	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	95422360	95764495	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	95769305	96165253	5	0
TCGA-EJ-A46G	X	96165312	96190577	4	0
TCGA-EJ-A46G	X	96190649	97980509	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	97985381	99333763	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	99336081	100713031	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	100715405	104039475	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	104044027	104472285	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	104473069	113593844	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	113594520	113912000	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	113913003	154929498	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	154963439	154983812	1	1
TCGA-EJ-A46G	X	154985852	155233846	2	1
