sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-49-AAR9	1	61735	121482979	4	0
TCGA-49-AAR9	1	144007049	189735091	4	2
TCGA-49-AAR9	1	189735107	200289594	4	4
TCGA-49-AAR9	1	200289610	237277055	4	3
TCGA-49-AAR9	1	237277098	242871812	4	4
TCGA-49-AAR9	1	242872709	249224388	4	3
TCGA-49-AAR9	2	12784	7190626	4	2
TCGA-49-AAR9	2	7192061	7324579	4	4
TCGA-49-AAR9	2	7327008	9201806	4	2
TCGA-49-AAR9	2	9205153	9460234	6	2
TCGA-49-AAR9	2	9460990	11254091	4	2
TCGA-49-AAR9	2	11257505	13631708	4	4
TCGA-49-AAR9	2	13637459	26466476	4	2
TCGA-49-AAR9	2	26470896	26579586	9	4
TCGA-49-AAR9	2	26579756	27631589	4	4
TCGA-49-AAR9	2	27635463	28281106	7	4
TCGA-49-AAR9	2	28289123	43586902	4	2
TCGA-49-AAR9	2	43587350	44070345	7	4
TCGA-49-AAR9	2	44070935	44747044	4	4
TCGA-49-AAR9	2	44748190	49198180	4	2
TCGA-49-AAR9	2	49198512	50383970	5	4
TCGA-49-AAR9	2	50384041	51569071	4	2
TCGA-49-AAR9	2	51569515	57589156	5	4
TCGA-49-AAR9	2	57592652	92305784	4	2
TCGA-49-AAR9	2	95327887	103956142	4	0
TCGA-49-AAR9	2	103966422	104094652	7	0
TCGA-49-AAR9	2	104101973	130400936	4	0
TCGA-49-AAR9	2	130401886	130629270	5	2
TCGA-49-AAR9	2	130629361	191838342	4	0
TCGA-49-AAR9	2	191838348	193491924	6	0
TCGA-49-AAR9	2	193493225	243089456	4	0
TCGA-49-AAR9	3	60345	18772770	7	0
TCGA-49-AAR9	3	18774984	52277036	3	0
TCGA-49-AAR9	3	52284712	52726376	6	0
TCGA-49-AAR9	3	52727257	59821980	3	0
TCGA-49-AAR9	3	59823781	60398156	3	2
TCGA-49-AAR9	3	60398303	60514736	2	0
TCGA-49-AAR9	3	60516181	60688702	3	2
TCGA-49-AAR9	3	60689395	60917246	2	0
TCGA-49-AAR9	3	60917485	63664560	3	2
TCGA-49-AAR9	3	63667528	64958388	7	2
TCGA-49-AAR9	3	64961390	66401918	8	2
TCGA-49-AAR9	3	66403284	67113253	6	2
TCGA-49-AAR9	3	67113777	68101739	6	0
TCGA-49-AAR9	3	68102243	69192757	4	2
TCGA-49-AAR9	3	69197457	71854153	2	2
TCGA-49-AAR9	3	71855028	71955940	4	2
TCGA-49-AAR9	3	71956442	72554563	2	2
TCGA-49-AAR9	3	72558999	73976238	4	2
TCGA-49-AAR9	3	73976514	93519478	2	2
TCGA-49-AAR9	3	93520016	94847031	4	0
TCGA-49-AAR9	3	94849534	104750644	4	2
TCGA-49-AAR9	3	104750825	105180929	4	0
TCGA-49-AAR9	3	105185483	105590247	4	2
TCGA-49-AAR9	3	105590533	107223736	4	0
TCGA-49-AAR9	3	107224046	107917031	4	2
TCGA-49-AAR9	3	107917227	108015329	5	4
TCGA-49-AAR9	3	108016810	109882494	4	2
TCGA-49-AAR9	3	109888549	118755319	4	0
TCGA-49-AAR9	3	118770052	119146248	4	1
TCGA-49-AAR9	3	119150491	119469025	4	0
TCGA-49-AAR9	3	119469439	120152498	4	2
TCGA-49-AAR9	3	120153464	141486180	4	0
TCGA-49-AAR9	3	141486583	197896118	4	2
TCGA-49-AAR9	4	12281	46949662	2	2
TCGA-49-AAR9	4	46949717	48364276	4	2
TCGA-49-AAR9	4	48372923	49579167	2	2
TCGA-49-AAR9	4	49584109	115242095	4	0
TCGA-49-AAR9	4	115243741	116739124	6	0
TCGA-49-AAR9	4	116739590	152083713	4	0
TCGA-49-AAR9	4	152089273	152337345	6	0
TCGA-49-AAR9	4	152339541	191027923	4	0
TCGA-49-AAR9	5	15532	7066727	4	2
TCGA-49-AAR9	5	7066899	7210573	7	2
TCGA-49-AAR9	5	7210627	11763030	4	2
TCGA-49-AAR9	5	11764369	12864621	4	0
TCGA-49-AAR9	5	12869862	18665096	4	2
TCGA-49-AAR9	5	18666822	20616080	4	0
TCGA-49-AAR9	5	20622266	42119622	4	2
TCGA-49-AAR9	5	42119990	46377327	5	4
TCGA-49-AAR9	5	46381782	54448165	4	2
TCGA-49-AAR9	5	54448253	55207047	6	0
TCGA-49-AAR9	5	55207550	59124724	6	2
TCGA-49-AAR9	5	59126334	62367724	6	0
TCGA-49-AAR9	5	62376919	64450308	4	0
TCGA-49-AAR9	5	64450437	154216605	2	0
TCGA-49-AAR9	5	154217021	180790320	2	2
TCGA-49-AAR9	6	149661	4812523	4	0
TCGA-49-AAR9	6	4815762	6082408	4	4
TCGA-49-AAR9	6	6082791	8390129	4	2
TCGA-49-AAR9	6	8391544	9096537	5	4
TCGA-49-AAR9	6	9098630	11317363	4	0
TCGA-49-AAR9	6	11320724	11629164	4	4
TCGA-49-AAR9	6	11634722	11976776	4	2
TCGA-49-AAR9	6	11978152	50914326	4	0
TCGA-49-AAR9	6	50914796	52629769	4	4
TCGA-49-AAR9	6	52630064	53034694	4	2
TCGA-49-AAR9	6	53035505	53440956	4	4
TCGA-49-AAR9	6	53444786	54429660	6	5
TCGA-49-AAR9	6	54430279	55225084	5	2
TCGA-49-AAR9	6	55237723	56514465	4	0
TCGA-49-AAR9	6	56516616	57577386	2	0
TCGA-49-AAR9	6	57582554	58013357	6	1
TCGA-49-AAR9	6	58013492	58082951	6	0
TCGA-49-AAR9	6	58140300	58740864	2	0
TCGA-49-AAR9	6	58741497	63769489	4	2
TCGA-49-AAR9	6	63769553	64797048	5	4
TCGA-49-AAR9	6	64797397	65822305	4	2
TCGA-49-AAR9	6	65824682	75939268	4	0
TCGA-49-AAR9	6	75940705	171051005	2	0
TCGA-49-AAR9	7	43259	23498185	4	0
TCGA-49-AAR9	7	23501094	38424065	2	0
TCGA-49-AAR9	7	38424328	38534759	2	2
TCGA-49-AAR9	7	38535160	46303593	2	0
TCGA-49-AAR9	7	46304822	46511393	5	2
TCGA-49-AAR9	7	46511845	52164981	2	0
TCGA-49-AAR9	7	52165041	52975364	5	2
TCGA-49-AAR9	7	52976820	63190607	2	0
TCGA-49-AAR9	7	63252830	75627574	2	2
TCGA-49-AAR9	7	75631486	78384655	2	0
TCGA-49-AAR9	7	78389261	81857765	2	2
TCGA-49-AAR9	7	81857893	83918762	4	0
TCGA-49-AAR9	7	83921789	90054744	2	0
TCGA-49-AAR9	7	90054853	91684415	2	2
TCGA-49-AAR9	7	91684947	93706220	2	0
TCGA-49-AAR9	7	93708158	94048686	2	2
TCGA-49-AAR9	7	94053725	99348580	2	0
TCGA-49-AAR9	7	99350918	99554769	4	2
TCGA-49-AAR9	7	99566264	109262515	2	0
TCGA-49-AAR9	7	109264025	110771561	4	0
TCGA-49-AAR9	7	110771832	112140430	4	2
TCGA-49-AAR9	7	112142467	148545971	2	2
TCGA-49-AAR9	7	148551602	150612630	4	2
TCGA-49-AAR9	7	150612918	158011694	2	2
TCGA-49-AAR9	7	158020147	159127004	2	0
TCGA-49-AAR9	8	31254	9860080	2	0
TCGA-49-AAR9	8	9861916	10800894	2	2
TCGA-49-AAR9	8	10803617	11272208	4	2
TCGA-49-AAR9	8	11278319	11513313	2	0
TCGA-49-AAR9	8	11514071	12234400	2	2
TCGA-49-AAR9	8	12239835	38724972	2	0
TCGA-49-AAR9	8	38727937	40123920	4	2
TCGA-49-AAR9	8	40124799	40771513	2	0
TCGA-49-AAR9	8	40771996	47908800	2	2
TCGA-49-AAR9	8	47910141	50024931	4	2
TCGA-49-AAR9	8	50024944	51212683	7	2
TCGA-49-AAR9	8	51215044	51424067	5	2
TCGA-49-AAR9	8	51435741	54122274	2	2
TCGA-49-AAR9	8	54125243	56105799	11	2
TCGA-49-AAR9	8	56112931	58848213	2	0
TCGA-49-AAR9	8	58850135	60451913	9	2
TCGA-49-AAR9	8	60452031	64858274	4	2
TCGA-49-AAR9	8	64860569	82966592	2	2
TCGA-49-AAR9	8	82967590	84635182	4	2
TCGA-49-AAR9	8	84635854	94640296	2	2
TCGA-49-AAR9	8	94640656	97021463	4	2
TCGA-49-AAR9	8	97022165	146298155	2	2
TCGA-49-AAR9	9	46587	1381203	2	2
TCGA-49-AAR9	9	1382843	6499117	2	0
TCGA-49-AAR9	9	6501060	8644711	2	2
TCGA-49-AAR9	9	8646021	14393854	2	0
TCGA-49-AAR9	9	14394245	17477659	2	2
TCGA-49-AAR9	9	17485382	33922103	2	0
TCGA-49-AAR9	9	33923773	34277531	2	2
TCGA-49-AAR9	9	34277808	47217176	2	0
TCGA-49-AAR9	9	65616971	71311252	4	0
TCGA-49-AAR9	9	71313742	72275322	2	0
TCGA-49-AAR9	9	72280691	72464074	7	0
TCGA-49-AAR9	9	72466275	76141472	2	0
TCGA-49-AAR9	9	76141658	97182750	4	0
TCGA-49-AAR9	9	97191379	97446007	6	0
TCGA-49-AAR9	9	97446312	123109213	4	0
TCGA-49-AAR9	9	123110320	124441848	6	0
TCGA-49-AAR9	9	124442040	141091394	4	0
TCGA-49-AAR9	10	72759	9485968	2	0
TCGA-49-AAR9	10	9487164	77344961	2	2
TCGA-49-AAR9	10	77347173	77386412	1	0
TCGA-49-AAR9	10	77388993	135506704	2	2
TCGA-49-AAR9	11	198572	30758500	3	0
TCGA-49-AAR9	11	30759214	32250517	3	2
TCGA-49-AAR9	11	32250778	33380379	2	2
TCGA-49-AAR9	11	33383085	34887098	2	0
TCGA-49-AAR9	11	34887458	35314299	2	2
TCGA-49-AAR9	11	35320084	35597658	4	2
TCGA-49-AAR9	11	35601486	41410806	2	2
TCGA-49-AAR9	11	41412014	42683497	2	0
TCGA-49-AAR9	11	42685636	54758291	2	2
TCGA-49-AAR9	11	54773893	55506548	2	0
TCGA-49-AAR9	11	55508167	75668560	2	2
TCGA-49-AAR9	11	75668635	76475729	4	2
TCGA-49-AAR9	11	76477172	103167688	2	2
TCGA-49-AAR9	11	103168242	105780455	4	2
TCGA-49-AAR9	11	105780478	106299359	2	2
TCGA-49-AAR9	11	106299410	106532188	5	2
TCGA-49-AAR9	11	106533817	127408927	2	2
TCGA-49-AAR9	11	127409293	128945244	4	2
TCGA-49-AAR9	11	128952951	134944770	2	2
TCGA-49-AAR9	12	150442	8705395	3	2
TCGA-49-AAR9	12	8705406	21748078	2	2
TCGA-49-AAR9	12	21750675	23185343	35	1
TCGA-49-AAR9	12	23185575	23608677	43	2
TCGA-49-AAR9	12	23611714	24017175	11	1
TCGA-49-AAR9	12	24022160	25456239	47	1
TCGA-49-AAR9	12	25461039	31540725	10	2
TCGA-49-AAR9	12	31541218	34854498	13	2
TCGA-49-AAR9	12	37857751	52101388	2	2
TCGA-49-AAR9	12	52103101	55364970	6	2
TCGA-49-AAR9	12	55364970	129475024	4	2
TCGA-49-AAR9	12	129475132	129486468	2	1
TCGA-49-AAR9	12	129486939	130488388	2	0
TCGA-49-AAR9	12	130488634	132377030	4	0
TCGA-49-AAR9	12	132377048	133778189	2	0
TCGA-49-AAR9	13	19026949	22788211	4	0
TCGA-49-AAR9	13	22788306	23533372	2	0
TCGA-49-AAR9	13	23545597	24019346	5	0
TCGA-49-AAR9	13	24021696	27054459	2	0
TCGA-49-AAR9	13	27059020	28892257	4	0
TCGA-49-AAR9	13	28892653	29672247	7	0
TCGA-49-AAR9	13	29677642	43397982	2	0
TCGA-49-AAR9	13	43398173	44908669	5	0
TCGA-49-AAR9	13	44908741	46080684	6	0
TCGA-49-AAR9	13	46086629	73664647	2	0
TCGA-49-AAR9	13	73674613	74774819	3	0
TCGA-49-AAR9	13	74775275	115108397	2	0
TCGA-49-AAR9	14	19002124	76435945	2	2
TCGA-49-AAR9	14	76437128	107285437	2	1
TCGA-49-AAR9	15	20016328	28113804	2	2
TCGA-49-AAR9	15	28114101	29653883	4	2
TCGA-49-AAR9	15	29653997	87640900	2	2
TCGA-49-AAR9	15	87645062	102469040	4	2
TCGA-49-AAR9	16	60777	647281	2	2
TCGA-49-AAR9	16	647297	2266803	4	2
TCGA-49-AAR9	16	2268349	9346448	2	2
TCGA-49-AAR9	16	9346758	9803756	4	2
TCGA-49-AAR9	16	9806191	90287535	2	2
TCGA-49-AAR9	17	526	21540367	2	0
TCGA-49-AAR9	17	21542097	33734498	2	2
TCGA-49-AAR9	17	33745448	35610806	4	2
TCGA-49-AAR9	17	35616544	59451139	2	2
TCGA-49-AAR9	17	59453458	65395023	4	2
TCGA-49-AAR9	17	65395058	79642211	4	4
TCGA-49-AAR9	17	79644247	81049726	6	4
TCGA-49-AAR9	18	48133	22733828	4	0
TCGA-49-AAR9	18	22734100	25298934	2	0
TCGA-49-AAR9	18	25299829	30741491	4	0
TCGA-49-AAR9	18	30741527	31149934	6	0
TCGA-49-AAR9	18	31159279	32853049	4	0
TCGA-49-AAR9	18	32858790	59230535	2	0
TCGA-49-AAR9	18	59231791	78015057	4	0
TCGA-49-AAR9	19	90910	24507167	2	0
TCGA-49-AAR9	19	24507172	35337481	4	0
TCGA-49-AAR9	19	35337534	46782577	6	0
TCGA-49-AAR9	19	46782606	48641574	4	0
TCGA-49-AAR9	19	48645229	50061111	6	0
TCGA-49-AAR9	19	50061391	55026398	4	0
TCGA-49-AAR9	19	55029447	59097854	6	0
TCGA-49-AAR9	20	61305	4820603	4	0
TCGA-49-AAR9	20	4821365	11020105	4	2
TCGA-49-AAR9	20	11020314	14899761	4	1
TCGA-49-AAR9	20	14899795	15033315	2	1
TCGA-49-AAR9	20	15035203	15181397	4	1
TCGA-49-AAR9	20	15181590	15540130	4	0
TCGA-49-AAR9	20	15542612	37773556	4	1
TCGA-49-AAR9	20	37775431	42584234	4	3
TCGA-49-AAR9	20	42584398	60282962	4	1
TCGA-49-AAR9	20	60288109	62956153	6	1
TCGA-49-AAR9	21	10736871	24534738	2	2
TCGA-49-AAR9	21	24534865	31202475	2	0
TCGA-49-AAR9	21	31207667	31436165	11	0
TCGA-49-AAR9	21	31436284	48096957	2	0
TCGA-49-AAR9	22	16052528	51234455	2	0
TCGA-49-AAR9	X	168477	1583540	4	0
TCGA-49-AAR9	X	1590657	2694240	4	1
TCGA-49-AAR9	X	2703391	37785535	5	0
TCGA-49-AAR9	X	37789024	61757923	4	0
TCGA-49-AAR9	X	61773575	125061607	2	0
TCGA-49-AAR9	X	125066176	125189080	5	0
TCGA-49-AAR9	X	125198083	134929686	2	0
TCGA-49-AAR9	X	134947387	136391940	4	0
TCGA-49-AAR9	X	136392476	154929498	2	0
TCGA-49-AAR9	X	154963439	155036599	6	1
TCGA-49-AAR9	X	155037556	155233846	5	1
